2006年2月20日下午，美国NimbleGen公司分子研究室主任Tom Albert博士应邀来我所作了“基因芯片技术的新进展——全基因组谱图和再测序”学术报告。传染病所的职工和研究生共计60余人参加,报告持续长达3个小时,与会人员对报告的内容产生了的浓厚兴趣，积极地参与交流和讨论，整个活动洋溢着热烈、友好的气氛。报告结束后，NimbleGen公司及冷泉港生物科技股份有限公司等主要业务人员与徐建国所长等有关专家代表进行了进一步交流与探讨，双方表达了对基因芯片技术的合作意向。本次活动由中国疾控中心传染病预防控制所与传染病预防控制国家重点实验室联合主办，冷泉港生物科技股份有限公司协办。
NimbleGen成功地推出微生物鉴定的新战略方案：用高密度寡核苷酸芯片（385,000探针/片）的技术平台，重新测序全部微生物基因组，在任何已测序的基因组中绘制转录单位、启动子结合位点和基因拷贝数差异的高精度图谱。重新测序业已应用于解决许多生物学问题，包括追踪流行病爆发时期从临床样本中分离得到的SARS冠状病毒和大肠杆菌O157:H7菌株的自然演化，以及跟踪实验室诱导产生的耐抗生素的幽门螺旋杆菌和结核分支杆菌菌株的演化，从而发现了几个全新的耐抗生素的抗性基因。
本报告将详细介绍通过ChIP－chip技术测定全基因组图谱上的活性启动子的方法。采用基因芯片结合染色体免疫沉淀（ChIP）技术，在人基因组范围内，转录模拟复合体结合来定位基因转录位点。所绘制的活性基因启动子图谱将已知的6,763个基因找到了相应的10,567个活性启动子，至少有1,196个尚未注释的转录单元。建立在基因芯片基础上的比较基因组杂交（CGH）分析是一个重要的研究工具，为研究频繁发生在诸如肿瘤、神经精神疾病、先天发育疾病等复杂疾病中的染色体结构异常，。NimbleGen的CGH是超高解析度(0.5–50 Kb)寡核苷酸芯片平台，检测全基因组上基因扩增、缺失，筛选相关断裂点，也可用于根据您的需求定制叠片芯片作以上检测。 应用叠片式芯片在不需要预先有基因组注释的情况下完成12号染色体上的转录单元的鉴定，并定量测定了每一个转录本的长度和丰度。
传染病所科教处
